Reactome | VHL [cytosol]

VHL [cytosol]

Stable Identifier

R-HSA-391423

Type

Protein [EntityWithAccessionedSequence]

Species

Homo sapiens

Compartment

cytosol

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Disease (Homo sapiens)

- Infectious disease (Homo sapiens)
  - Viral Infection Pathways (Homo sapiens)
    - SARS-CoV Infections (Homo sapiens)
      - SARS-CoV-1 Infection (Homo sapiens)
        
        SARS-CoV-1 Genome Replication and Transcription (Homo sapiens)
        
        Replication of the SARS-CoV-1 genome (Homo sapiens)
        
        nsp16 binds VHL (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        nsp16:VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - SARS-CoV-2 Infection (Homo sapiens)
        
        Early SARS-CoV-2 Infection Events (Homo sapiens)
        
        SARS-CoV-2 Genome Replication and Transcription (Homo sapiens)
        
        Replication of the SARS-CoV-2 genome (Homo sapiens)
        
        nsp16 binds VHL (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        nsp16:VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)

Immune System (Homo sapiens)

- Adaptive Immune System (Homo sapiens)
  - Class I MHC mediated antigen processing & presentation (Homo sapiens)
    - Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation (Homo sapiens)
      - Interaction of E3 with substrate and E2-Ub complex (Homo sapiens)
        
        Ag-substrate:E3:E2:Ub [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3 ligases in proteasomal degradation [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1-CUL2-EloB,C-VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3 ligases in proteasomal degradation [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1-CUL2-EloB,C-VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - Polyubiquitination of substrate (Homo sapiens)
        
        E3 ligases in proteasomal degradation [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1-CUL2-EloB,C-VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3:K48-polyubiquitinated substrate [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3 ligases in proteasomal degradation [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1-CUL2-EloB,C-VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3:Ub:substrate [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3 ligases in proteasomal degradation [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1-CUL2-EloB,C-VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - Release of E3 from polyubiquitinated substrate (Homo sapiens)
        
        E3 ligases in proteasomal degradation [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1-CUL2-EloB,C-VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3:K48-polyubiquitinated substrate [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3 ligases in proteasomal degradation [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1-CUL2-EloB,C-VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - Transfer of Ub from E2 to substrate and release of E2 (Homo sapiens)
        
        Ag-substrate:E3:E2:Ub [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3 ligases in proteasomal degradation [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1-CUL2-EloB,C-VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3 ligases in proteasomal degradation [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1-CUL2-EloB,C-VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3:Ub:substrate [cytosol] (Homo sapiens)
        
        E3 ligases in proteasomal degradation [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1-CUL2-EloB,C-VHL [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)

Metabolism of proteins (Homo sapiens)

- Post-translational protein modification (Homo sapiens)
  - Neddylation (Homo sapiens)
    - 26S proteasome degrades HIFalpha (Homo sapiens)
      - RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - ub-hydroxyPro-HIF-alpha:VHL:EloB:EloC:NEDD8-CUL2:RBX1:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
    - AcM-UBE2M transfers NEDD8 to CRL2 E3 ubiquitin ligase complex (Homo sapiens)
      - NEDD8-AcM-UBE2M:CRL2 E3 ubiquitin ligase:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase:COMMDs:CCDC22 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CUL2-box protein [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - NEDD8-CRL2 E3 ubiquitin ligase:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        NEDD8-CRL2 E3 ligase complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CUL2-box protein [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
    - CAND1 binds cytosolic CRL E3 ubiquitin ligases (Homo sapiens)
      - CRL E3 ubiquitin ligase:CAND1 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL E3 ubiquitin ligases [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CUL2-box protein [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - CRL E3 ubiquitin ligases [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CUL2-box protein [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
    - COMMDs displace CAND1 from cytosolic CRL E3 ubiquitin ligase complexes (Homo sapiens)
      - CRL E3 ubiquitin ligase:CAND1 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL E3 ubiquitin ligases [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CUL2-box protein [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - CRL E3 ubiquitin ligase:COMMDs:CCDC22 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase:COMMDs:CCDC22 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CUL2-box protein [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
    - COP9 signalosome deneddylates cytosolic CRL E3 ubiquitin ligase complexes (Homo sapiens)
      - CRL E3 ubiquitin ligase complex:COMMDs:CCDC22:DCUN1Ds [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CUL2-box protein [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - NEDD8 CRL E3 ubiquitin ligases:COMMDs:CCDC22:DCUN1Ds [cytosol] (Homo sapiens)
        
        NEDD8-CRL2 E3 ubiquitin ligase:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        NEDD8-CRL2 E3 ligase complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CUL2-box protein [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
    - NEDD8:AcM-UBE2M binds CRL2 E3 ubiquitin ligase complex (Homo sapiens)
      - CRL2 E3 ubiquitin ligase:COMMDs:CCDC22 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CUL2-box protein [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - NEDD8-AcM-UBE2M:CRL2 E3 ubiquitin ligase:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase:COMMDs:CCDC22 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CRL2 E3 ubiquitin ligase [cytosol] (Homo sapiens)
        
        CUL2-box protein [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
    - VHL:EloB,C:NEDD8-CUL2:RBX1 complex binds UBXN7 (Homo sapiens)
      - RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5:UBXN7 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
    - VHL:EloB,C:NEDD8-CUL2:RBX1 complex binds hydroxyprolyl-HIF-alpha (Homo sapiens)
      - RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5:hydroxyPro-HIF-alpha [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
    - VHL:EloB,C:NEDD8-CUL2:RBX1 complex ubiquitinylates HIF-alpha (Homo sapiens)
      - RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5:UBXN7 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5:hydroxyPro-HIF-alpha [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)
      - ub-hydroxyPro-HIF-alpha:VHL:EloB:EloC:NEDD8-CUL2:RBX1:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RBX1:NEDD8-CUL2:EloB,C:VHL:COMMDs:CCDC22:DCUN1D1,2,4,5 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VBC complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        VHL [cytosol] (Homo sapiens)

External Reference Information

External Reference

UniProt:P40337 VHL

Gene Names

VHL

Chain

chain:1-213

Reference Genes

BioGPS Gene:7428 VHL

COSMIC (genes):VHL VHL

CTD Gene:7428 VHL

dbSNP Gene:7428 VHL

ENSEMBL:ENSG00000134086 VHL

ENSEMBL_homo_sapiens_GENE:ENSG00000134086.9 VHL

HGNC:12687 VHL

KEGG Gene (Homo sapiens):7428 VHL

Monarch:7428 VHL

NCBI Gene:7428 VHL

OMIM:608537 VHL

UCSC:P40337 VHL

Reference Transcript

Other Identifiers

11748633_a_at

11752180_x_at

1559227_PM_s_at

1559227_s_at

1668_s_at

16937571

203844_PM_at

203844_at

2610338

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40871_at

7428

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A_23_P132606

A_24_P134942

A_33_P3419938

GE54104

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HMNXSV003025175

Hs2.421597.1.A1_3p_s_at

ILMN_1738579

ILMN_1801984

ILMN_2376625

L15409_at

PH_hs_0033268

TC03000055.hg

TC03002213.hg

g4507890_3p_at

Participates

as a member of

as an input of

as a component of

Other forms of this molecule

monoSUMO1-K159,171,196-VHL [nucleoplasm]

VHL [nucleoplasm]

Inferred To

Vhl [cytosol] (Drosophila melanogaster)

Vhl [cytosol] (Mus musculus)

Vhl [cytosol] (Rattus norvegicus)

vhl [cytosol] (Danio rerio)

vhl-1 [cytosol] (Caenorhabditis elegans)

Ghost homologue of VHL [cytosol] (Dictyostelium discoideum)

Ghost homologue of VHL [cytosol] (Sus scrofa)

Ghost homologue of VHL [cytosol] (Xenopus tropicalis)

VHL [cytosol] (Bos taurus)

VHL [cytosol] (Canis familiaris)

VHL [cytosol] (Gallus gallus)

Cross References

RefSeq

NP_937799.1, NP_000542.1

Guide to Pharmacology - Targets

3204

OpenTargets

ENSG00000134086

ZINC - Substances

VHL_HUMAN

ZINC target

P40337

PRO

P40337

PDB

6GMX, 4WQO, 4W9G, 6R6H, 3ZTD, 8BB2, 8VLB, 8BB3, 3ZTC, 8P0F, 8QW7, 8QW6, 6GMR, 4AWJ, 6I7Q, 7Z77, 8G1Q, 5NVY, 6HAX, 8CQK, 8RX0, 1LQB, 5NVZ, 6HAY, 4W9I, 8G1P, 8FY2, 8FY1, 7CJB, 4W9D, 8BDX, 3ZRF, 6ZHC, 6HR2, 8PC2, 8BDO, 8R5H, 8QU8, 7PI4, 8BDN, 8BDJ, 6GFY, 6FMJ, 8C13, 8CQL, 6GFZ, 5NW1, 8EI3, 5NW0, 4W9J, 8BB4, 1LM8, 4W9E, 8BB5, 5LLI, 4B95, 7S4E, 4W9F, 4AJY, 8VL9, 6GMQ, 8QJS, 8QJR, 8QVU, 6GMN, 4W9C, 6BVB, 4B9K, 6I7R, 8RWZ, 4BKT, 8BDI, 6FMI, 7KHH, 1VCB, 8BEB, 4W9H, 5NVW, 8CQE, 5NVX, 7ZNT, 3ZRC, 5NVV, 5T35, 8BDT, 8FY0, 8BDS, 7Q2J, 8BDM, 3ZUN, 5N4W, 8EWV, 8BDL, 6R7F, 6SIS, 4BKS, 7Z76, 6FMK, 4W9K, 7JTP, 4W9L, 5NW2, 6GFX, 7JTO, 7Z6L

HPA

ENSG00000134086-VHL

GeneCards

P40337

Ensembl

ENSP00000256474, ENSP00000344757, ENST00000256474, ENSG00000134086, ENST00000345392

Pharos - Targets

P40337

Orphanet

15708

ZINC - Predictions - Purchasable

VHL_HUMAN

Interactors (16)

Accession	#Entities	Entities	Confidence Score	Evidence (IntAct)
UniProt:Q16665 HIF1A	7	HN-HIF1A [cytosol] (R-HSA-1234110) 2xHP-HIF1A [nucleoplasm] (R-HSA-1234105) 2xHP-HIF1A [cytosol] (R-HSA-1234131) p-Y565,S797-HIF1A [cytosol] (R-HSA-9634700) p-Y565-HIF1A [cytosol] (R-HSA-8857584) HIF1A [cytosol] (R-HSA-1234102) HIF1A [nucleoplasm] (R-HSA-1234135)	0.962	22
UniProt:Q15370 ELOB	2	TCEB2 [nucleoplasm] (R-HSA-112423) ELOB [cytosol] (R-HSA-180551)	0.94	13
UniProt:Q13617 CUL2	3	G76-NEDD8-K689-CUL2 [cytosol] (R-HSA-8952511) CUL2 [nucleoplasm] (R-HSA-1234126) CUL2 [cytosol] (R-HSA-416982)	0.916	19
UniProt:Q15369 ELOC	2	TCEB1 [nucleoplasm] (R-HSA-112422) ELOC [cytosol] (R-HSA-180535)	0.871	10
UniProt:Q99750 MDFI			0.666	4
UniProt:Q99814 EPAS1 (HIF2A)	5	HN-EPAS1 [cytosol] (R-HSA-1234112) 2xHP-EPAS1 [nucleoplasm] (R-HSA-1234151) 2xHP-EPAS1 [cytosol] (R-HSA-1234149) EPAS1 [nucleoplasm] (R-HSA-452560) EPAS1 [cytosol] (R-HSA-1234119)	0.659	3
UniProt:P62877 RBX1	2	RBX1 [nucleoplasm] (R-HSA-1234142) RBX1 [cytosol] (R-HSA-180582)	0.623	4
UniProt:P63244 RACK1	1	GNB2L1 [cytosol] (R-HSA-5626956)	0.611	9
UniProt:P0C6X7-PRO_0000037322 REP			0.602	7
UniProt:P21980 TGM2			0.602	10
UniProt:Q99873 PRMT1	2	PRMT1 [cytosol] (R-HSA-9632173) PRMT1 [nucleoplasm] (R-HSA-3215140)	0.508	2
UniProt:Q61221	7	Hif1a [cytosol] (R-MMU-1234110) Hif1a [nucleoplasm] (R-MMU-1234105) Hif1a [cytosol] (R-MMU-1234131) phospho-Hif1a [cytosol] (R-MMU-9634700) phospho-Hif1a [cytosol] (R-MMU-8857584) Hif1a [cytosol] (R-MMU-1234102) Hif1a [nucleoplasm] (R-MMU-1234135)	0.499	3
UniProt:P02751 FN1	10	FN1(32-2386) [platelet alpha granule lumen] (R-HSA-114620) FN1(32-271) [extracellular region] (R-HSA-3787935) FN1(272-2386) [extracellular region] (R-HSA-3788024) FN1(32-?) [extracellular region] (R-HSA-2533850) FN1(?-2386) [extracellular region] (R-HSA-2533841) FN1(32-1201)-p-7Y-ALK(1022-1620) fusion [plasma membrane] (R-HSA-9713462) FN1(32-1201)-ALK(1022-1620) fusion [plasma membrane] (R-HSA-9713459) p-FN1 [endoplasmic reticulum lumen] (R-HSA-8956937) FN1 [endoplasmic reticulum lumen] (R-HSA-8956708) FN1(32-2386) [extracellular region] (R-HSA-54851)	0.499	2
UniProt:Q13231 CHIT1	3	CHIT1 [specific granule lumen] (R-HSA-6799529) CHIT1 [extracellular region] (R-HSA-6786396) CHIT1 [tertiary granule lumen] (R-HSA-6800898)	0.499	2
UniProt:Q05513 PRKCZ	5	p-T410,T563-PRKCZ [cytosol] (R-HSA-5218698) PRKCZ [cytosol] (R-HSA-58218) PRKCZ [cell junction] (R-HSA-2134483) p-T410-PRKCZ [cytosol] (R-HSA-437181) pS, p-T410-PRKCZ [cytosol] (R-HSA-9632824)	0.463	3
UniProt:P08151 GLI1	9	ub-GLI1 [cytosol] (R-HSA-5635833) ub-pS-GLI1 [ciliary base] (R-HSA-5610514) pS-GLI1 [ciliary base] (R-HSA-5610497) GLI1 [cytosol] (R-HSA-445457) p-GLI1 [ciliary tip] (R-HSA-5635040) 2p-GLI1 [nucleoplasm] (R-HSA-5635057) p-GLI1 [nucleoplasm] (R-HSA-5635042) GLI1 [ciliary tip] (R-HSA-5610360) GLI1 [ciliary base] (R-HSA-5610357)	0.463	2

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