Reactome | ATP6V0B [lysosomal membrane]

ATP6V0B [lysosomal membrane]

Stable Identifier

R-HSA-9640187

Type

Protein [EntityWithAccessionedSequence]

Species

Homo sapiens

Compartment

lysosomal membrane

Synonyms

V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit, VATO_HUMAN

Locations in the PathwayBrowser

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Cellular responses to stimuli (Homo sapiens)

- Cellular responses to stress (Homo sapiens)
  - Cellular response to starvation (Homo sapiens)
    - Amino acids regulate mTORC1 (Homo sapiens)
      - RRAGA,B exchanges GDP for GTP (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GDP:RRAGC,D:GDP:SLC38A9:Arg [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GDP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
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        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP:SLC38A9:Arg [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
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        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
      - RRAGA,B hydrolyzes GTP (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GDP:RRAGC,D:GDP:mTORC1:RHEB:GTP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GDP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
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        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP:mTORC1:RHEB:GTP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP:mTORC1 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
      - RRAGC,D exchanges GTP for GDP (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GDP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
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        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GDP:RRAGC,D:GTP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
      - RRAGC,D hydrolyzes GTP (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GDP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
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        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GDP:RRAGC,D:GTP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
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        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
      - mTORC1 binds RHEB:GTP (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP:mTORC1 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
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        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP:mTORC1:RHEB:GTP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP:mTORC1 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
      - v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP binds mTORC1 (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP:mTORC1 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
      - v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP:SLC38A9:Arginine dissociates yielding v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP and SLC38A9:Arginine (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP:SLC38A9:Arg [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GTP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
      - v-ATPase:Ragulator:RagA,B:GDP:RagC,D:GDP binds SLC38A9:Arginine (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GDP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GDP:RRAGC,D:GDP:SLC38A9:Arg [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator:RRAGA,B:GDP:RRAGC,D:GDP [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase:Ragulator [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        v-ATPase [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)
        
        ATP6V0B [lysosomal membrane] (Homo sapiens)

External Reference Information

External Reference

UniProt:Q99437 ATP6V0B

Gene Names

ATP6V0B, ATP6F

Chain

chain:1-205

Reference Genes

BioGPS Gene:533 ATP6V0B

COSMIC (genes):ATP6V0B ATP6V0B

CTD Gene:533 ATP6V0B

dbSNP Gene:533 ATP6V0B

ENSEMBL:ENSG00000117410 ATP6V0B

HGNC:861 ATP6V0B

KEGG:hsa:533 ATP6V0B

Monarch:533 ATP6V0B

NCBI Gene:533 ATP6V0B

OMIM:603717 ATP6V0B

UCSC:Q99437 ATP6V0B

Reference Transcript

Other Identifiers

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HMNXSV003005493

ILMN_1712518

ILMN_1721391

ILMN_1806508

ILMN_2353642

PH_hs_0000774

TC01000555.hg

g13543437_3p_s_at

Participates

as an output of

MITF-M-dependent ATP6V0B gene expression (Homo sapiens)

as a component of

ATP6V0 [lysosomal membrane] (Homo sapiens)

Other forms of this molecule

ATP6V0B [endosome membrane]

ATP6V0B [phagocytic vesicle membrane]

Inferred To

Ghost homologue of ATP6V0B [lysosomal membrane] (Danio rerio)

atp6v0b [lysosomal membrane] (Xenopus tropicalis)

Atp6v0b [lysosomal membrane] (Mus musculus)

Atp6v0b [lysosomal membrane] (Rattus norvegicus)

vha-4 [lysosomal membrane] (Caenorhabditis elegans)

ATP6V0B [lysosomal membrane] (Bos taurus)

ATP6V0B [lysosomal membrane] (Canis familiaris)

ATP6V0B [lysosomal membrane] (Dictyostelium discoideum)

ATP6V0B [lysosomal membrane] (Gallus gallus)

ATP6V0B [lysosomal membrane] (Sus scrofa)

VMA16 [lysosomal membrane] (Saccharomyces cerevisiae)

vma16 [lysosomal membrane] (Schizosaccharomyces pombe)

VhaPPA1-1 [lysosomal membrane] (Drosophila melanogaster)

Cross References

RefSeq

NP_001034546.1, NP_004038.1

Guide to Pharmacology - Targets

827

OpenTargets

ENSG00000117410

ENSEMBL

ENSP00000431605, ENSP00000434094, ENSP00000236067, ENST00000472174, ENST00000498664, ENST00000236067

HPA

ENSG00000117410-ATP6V0B

PRO

Q99437

Pharos - Targets

Q99437

PDB

7UNF, 6WM4, 6WLW, 6WM2, 6WM3, 7U4T

Interactors (21)

Accession	#Entities	Entities	Confidence Score	Evidence (IntAct)
UniProt:P22732 SLC2A5	2	SLC2A5 [specific granule membrane] (R-HSA-6799571) SLC2A5 [plasma membrane] (R-HSA-189202)	0.556	3
UniProt:P26715 KLRC1	1	KLRC1 [plasma membrane] (R-HSA-3006545)	0.556	3
UniProt:Q14973 SLC10A1	1	SLC10A1 [plasma membrane] (R-HSA-194116)	0.556	3
UniProt:P05090 APOD	1	APOD [extracellular region] (R-HSA-5216199)	0.556	3
UniProt:P29400-2 COL4A5			0.556	3
UniProt:O15529 GPR42			0.556	3
UniProt:Q96DZ7 T4S19			0.556	3
UniProt:Q9Y5U4 INSIG2	1	INSIG2 [endoplasmic reticulum membrane] (R-HSA-1655736)	0.556	3
UniProt:Q3ZAQ7 VMA21			0.556	3
UniProt:Q9HBV2 SACA1			0.556	3
UniProt:Q86Y34 ADGRG3	2	GPR97 [plasma membrane] (R-HSA-6806295) GPR97 [specific granule membrane] (R-HSA-6799649)	0.556	3
UniProt:P27105 STOM	4	STOM [azurophil granule membrane] (R-HSA-6800997) STOM [plasma membrane] (R-HSA-6806258) STOM [specific granule membrane] (R-HSA-6799569) STOM [tertiary granule membrane] (R-HSA-6800960)	0.556	3
UniProt:Q9GZY8-5 MFF			0.556	3
UniProt:P54849 EMP1			0.556	3
UniProt:P48165 GJA8	1	GJA8 [endoplasmic reticulum membrane] (R-HSA-190702)	0.556	3
UniProt:P30301 MIP	1	MIP [plasma membrane] (R-HSA-432026)	0.556	3
UniProt:Q96KR6 F210B			0.556	3
UniProt:Q9NWH2 TM242			0.556	3
UniProt:Q8IXM6 NRM			0.556	3
UniProt:Q96HJ5 MS4A3	2	MS4A3 [plasma membrane] (R-HSA-6806321) MS4A3 [specific granule membrane] (R-HSA-6799514)	0.556	5
UniProt:Q9BZJ8 GPR61			0.556	3

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